te recomiendo que revises hasta cuantos GB aguanta el nintendo switch, me paso algo similar con una cámara fotográfica me marcaba error, y después revisé que lo máximo que soportaba la cámara eran 60 GB, cuando le compre de esa capacidad dejo de marcarme error.
La especificacion en la pagina de Nintendo Switch marca: 32 GB de memoria interna, una porción se reserva para los requerimientos del sistema. Los usuarios pueden ampliar fácilmente la capacidad de almacenamiento usando tarjetas microSDHC o microSDXC hasta de 2TB (se venden por separado). Seguramente te dió problemas porque no era SDHC o SDXC.
Asegurate que tenga alguna de estas características.